MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus M013 chromosome

Total Repeats: 54116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016928	TAT	2	6	667	672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019813
2	NC_016928	CAA	2	6	705	710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019813
3	NC_016928	TGT	2	6	743	748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019813
4	NC_016928	TAC	2	6	776	781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019813
5	NC_016928	GAA	2	6	783	788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019813
6	NC_016928	TAA	2	6	803	808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019813
7	NC_016928	ACA	2	6	831	836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019813
8	NC_016928	AAC	2	6	851	856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019813
9	NC_016928	AG	3	6	879	884	50 %	0 %	50 %	0 %	379019813
10	NC_016928	ATT	2	6	995	1000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019813
11	NC_016928	GGTT	2	8	1013	1020	0 %	50 %	50 %	0 %	379019813
12	NC_016928	ATGC	2	8	1038	1045	25 %	25 %	25 %	25 %	379019813
13	NC_016928	TCA	2	6	1052	1057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019813
14	NC_016928	ATA	2	6	1066	1071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019813
15	NC_016928	TTA	2	6	1123	1128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019813
16	NC_016928	TTA	2	6	1188	1193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019813
17	NC_016928	GAT	2	6	1197	1202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019813
18	NC_016928	AAG	2	6	1234	1239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019813
19	NC_016928	AGA	2	6	1328	1333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019813
20	NC_016928	TTG	2	6	1366	1371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019813
21	NC_016928	CCA	2	6	1380	1385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379019813
22	NC_016928	AGA	2	6	1414	1419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019813
23	NC_016928	GAA	3	9	1425	1433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019813
24	NC_016928	CCA	2	6	1446	1451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379019813
25	NC_016928	TA	3	6	1464	1469	50 %	50 %	0 %	0 %	379019813
26	NC_016928	CAAAT	2	10	1471	1480	60 %	20 %	0 %	20 %	379019813
27	NC_016928	ATT	2	6	1538	1543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019813
28	NC_016928	CTG	2	6	1570	1575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019813
29	NC_016928	A	6	6	1636	1641	100 %	0 %	0 %	0 %	379019813
30	NC_016928	A	7	7	1685	1691	100 %	0 %	0 %	0 %	379019813
31	NC_016928	AG	3	6	1740	1745	50 %	0 %	50 %	0 %	379019813
32	NC_016928	GAA	2	6	1776	1781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019813
33	NC_016928	TGG	2	6	1784	1789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019813
34	NC_016928	TCAT	2	8	1807	1814	25 %	50 %	0 %	25 %	379019813
35	NC_016928	A	6	6	1822	1827	100 %	0 %	0 %	0 %	379019813
36	NC_016928	AGA	2	6	1844	1849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019813
37	NC_016928	AAG	2	6	1864	1869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019813
38	NC_016928	TAAT	2	8	2176	2183	50 %	50 %	0 %	0 %	379019814
39	NC_016928	ATT	2	6	2207	2212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019814
40	NC_016928	TTA	2	6	2213	2218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019814
41	NC_016928	AAC	2	6	2256	2261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019814
42	NC_016928	AGT	2	6	2406	2411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019814
43	NC_016928	TTG	2	6	2429	2434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019814
44	NC_016928	A	7	7	2442	2448	100 %	0 %	0 %	0 %	379019814
45	NC_016928	ATTA	2	8	2496	2503	50 %	50 %	0 %	0 %	379019814
46	NC_016928	AATTT	2	10	2519	2528	40 %	60 %	0 %	0 %	379019814
47	NC_016928	TTA	2	6	2557	2562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019814
48	NC_016928	CAATT	2	10	2585	2594	40 %	40 %	0 %	20 %	379019814
49	NC_016928	GACT	2	8	2718	2725	25 %	25 %	25 %	25 %	379019814
50	NC_016928	AGA	2	6	2757	2762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019814
51	NC_016928	TCA	2	6	2783	2788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019814
52	NC_016928	TAAA	2	8	2813	2820	75 %	25 %	0 %	0 %	379019814
53	NC_016928	GAA	2	6	2836	2841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019814
54	NC_016928	TCT	2	6	2852	2857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019814
55	NC_016928	TTTA	2	8	2874	2881	25 %	75 %	0 %	0 %	379019814
56	NC_016928	ATT	2	6	2910	2915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019814
57	NC_016928	ACA	2	6	2935	2940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019814
58	NC_016928	AAATT	2	10	2963	2972	60 %	40 %	0 %	0 %	379019814
59	NC_016928	TTA	2	6	3019	3024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019814
60	NC_016928	GGT	2	6	3034	3039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019814
61	NC_016928	TGA	2	6	3066	3071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019814
62	NC_016928	GTT	2	6	3073	3078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019814
63	NC_016928	TCT	2	6	3085	3090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019814
64	NC_016928	AGA	2	6	3117	3122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019814
65	NC_016928	GGT	2	6	3145	3150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019814
66	NC_016928	TTCA	2	8	3162	3169	25 %	50 %	0 %	25 %	379019814
67	NC_016928	AT	3	6	3177	3182	50 %	50 %	0 %	0 %	379019814
68	NC_016928	GATG	2	8	3183	3190	25 %	25 %	50 %	0 %	379019814
69	NC_016928	ATG	2	6	3209	3214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019814
70	NC_016928	GTTGAA	2	12	3217	3228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019814
71	NC_016928	TTC	2	6	3229	3234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019814
72	NC_016928	GAC	2	6	3271	3276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019814
73	NC_016928	AATT	2	8	3287	3294	50 %	50 %	0 %	0 %	379019814
74	NC_016928	AGA	2	6	3580	3585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019815
75	NC_016928	AT	3	6	3592	3597	50 %	50 %	0 %	0 %	379019815
76	NC_016928	A	7	7	3606	3612	100 %	0 %	0 %	0 %	379019815
77	NC_016928	GAAA	2	8	3643	3650	75 %	0 %	25 %	0 %	379019815
78	NC_016928	AGTA	2	8	3702	3709	50 %	25 %	25 %	0 %	379019815
79	NC_016928	ACC	2	6	3711	3716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379019815
80	NC_016928	ATC	2	6	3729	3734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019815
81	NC_016928	TTG	2	6	3737	3742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019815
82	NC_016928	AGT	2	6	3760	3765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019815
83	NC_016928	GTAG	2	8	3850	3857	25 %	25 %	50 %	0 %	379019815
84	NC_016928	A	6	6	3862	3867	100 %	0 %	0 %	0 %	379019815
85	NC_016928	GAA	2	6	3931	3936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019815
86	NC_016928	GA	3	6	3956	3961	50 %	0 %	50 %	0 %	379019815
87	NC_016928	AGAA	2	8	3973	3980	75 %	0 %	25 %	0 %	379019815
88	NC_016928	A	6	6	3979	3984	100 %	0 %	0 %	0 %	379019815
89	NC_016928	AAG	2	6	4455	4460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019816
90	NC_016928	GTA	2	6	4463	4468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019816
91	NC_016928	ATT	2	6	4511	4516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019816
92	NC_016928	TGG	2	6	4522	4527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019816
93	NC_016928	ATTA	2	8	4561	4568	50 %	50 %	0 %	0 %	379019816
94	NC_016928	TTCT	2	8	4651	4658	0 %	75 %	0 %	25 %	379019816
95	NC_016928	TCAT	2	8	4662	4669	25 %	50 %	0 %	25 %	379019816
96	NC_016928	ATG	2	6	4721	4726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019817
97	NC_016928	A	6	6	4945	4950	100 %	0 %	0 %	0 %	379019817
98	NC_016928	AT	3	6	4998	5003	50 %	50 %	0 %	0 %	379019817
99	NC_016928	AGA	2	6	5034	5039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019817
100	NC_016928	CTC	2	6	5060	5065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379019817
101	NC_016928	GAC	2	6	5072	5077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019817
102	NC_016928	CTG	2	6	5108	5113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019817
103	NC_016928	AAT	2	6	5161	5166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019817
104	NC_016928	A	7	7	5192	5198	100 %	0 %	0 %	0 %	379019817
105	NC_016928	CAG	2	6	5227	5232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019817
106	NC_016928	AAG	2	6	5333	5338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019817
107	NC_016928	ATT	2	6	5351	5356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019817
108	NC_016928	ATA	2	6	5429	5434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019817
109	NC_016928	GAT	2	6	5482	5487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019817
110	NC_016928	TTA	3	9	5617	5625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019817
111	NC_016928	GAT	2	6	5647	5652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019817
112	NC_016928	TTA	2	6	5668	5673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019817
113	NC_016928	ACA	2	6	5828	5833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019818
114	NC_016928	GTAT	2	8	5900	5907	25 %	50 %	25 %	0 %	379019818
115	NC_016928	AG	4	8	5922	5929	50 %	0 %	50 %	0 %	379019818
116	NC_016928	ATA	2	6	5960	5965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019818
117	NC_016928	CAAAT	2	10	5993	6002	60 %	20 %	0 %	20 %	379019818
118	NC_016928	GTT	2	6	6007	6012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019818
119	NC_016928	A	6	6	6077	6082	100 %	0 %	0 %	0 %	379019818
120	NC_016928	TGG	2	6	6126	6131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019818
121	NC_016928	TGGCGG	2	12	6138	6149	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	379019818
122	NC_016928	TGG	2	6	6162	6167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019818
123	NC_016928	TCA	2	6	6184	6189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019818
124	NC_016928	TA	3	6	6243	6248	50 %	50 %	0 %	0 %	379019818
125	NC_016928	TCA	2	6	6249	6254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019818
126	NC_016928	A	6	6	6262	6267	100 %	0 %	0 %	0 %	379019818
127	NC_016928	AAG	2	6	6290	6295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019818
128	NC_016928	AG	3	6	6400	6405	50 %	0 %	50 %	0 %	379019818
129	NC_016928	TGA	2	6	6453	6458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019818
130	NC_016928	AGA	2	6	6471	6476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019818
131	NC_016928	ATG	2	6	6545	6550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019818
132	NC_016928	TCA	2	6	6564	6569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019818
133	NC_016928	GAT	2	6	6577	6582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019818
134	NC_016928	TACG	2	8	6657	6664	25 %	25 %	25 %	25 %	379019818
135	NC_016928	GGT	2	6	6667	6672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019818
136	NC_016928	AGA	2	6	6747	6752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019818
137	NC_016928	TATC	2	8	6803	6810	25 %	50 %	0 %	25 %	379019818
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173	NC_016928	A	6	6	8597	8602	100 %	0 %	0 %	0 %	379019819
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256	NC_016928	TAT	2	6	12046	12051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019821
257	NC_016928	CAA	2	6	12065	12070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019821
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260	NC_016928	GAA	2	6	12158	12163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019821
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262	NC_016928	TA	3	6	12281	12286	50 %	50 %	0 %	0 %	379019821
263	NC_016928	AGA	2	6	12292	12297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019821
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392	NC_016928	TCAAT	2	10	19675	19684	40 %	40 %	0 %	20 %	379019827
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405	NC_016928	TTA	2	6	20275	20280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019827
406	NC_016928	GAT	2	6	20286	20291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019827
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